Struttura e topologia del DNA, organizzazione della cromatina Struttura degli acidi nucleici; denaturazione e rinaturazione del DNA; superavvolgimenti e parametri topologici; ruolo funzionale dei superavvolgimenti; le topoisomerasi e loro meccanismo di azione; istoni e nucleosomi; modificazioni enzimatiche degli istoni; livelli di organizzazione della cromatina Replicazione del DNA Le DNA polimerasi procariotiche; attivita' enzimatiche delle polimerasi e loro significato; l'inizio della replicazione; origini di replicazione e proteine del complesso di inizio; assemblaggio del replisoma; sintesi coordinata sui due stampi; la terminazione della replicazione Le attivita' polimerasiche degli eucarioti; la replicazione alle estremita' dei cromosomi: telomerasi Restrizione, riparo e ricombinazione Meccanismi molecolari e funzionali di restrizione e modificazione del DNA, metilasi; sistemi di riparo in E coli; i sistemi Mut e Uvr; meccanismi di riparo per escissione della base ed escissione dei nucleotidi; meccanismi di riparo diretto; la risposta SOS; riparo per ricombinazione; meccanismi molecolari della ricombinazione; RecA/B/C/D; modello di Holliday; risoluzioni delle giunzioni di Holliday, proteine RuvA/B/C Trascrizione in procarioti RNA polimerasi di E coli; elementi in cis della trascrizione; i promotori; complesso di inizio della trascrizione; subunita' sigma alternative; l'impronta della polimerasi sul promotore; la fase di allungamento della trascrizione; terminazione rho-indipendente e rho-dipendente; antiterminazione; cistroni ed operoni; il lac operon; struttura del repressore; il fattore CAP; accoppiamento trascrizione-traduzione; attenuazione ed operone Trp Trascrizione in eucarioti Le RNA polimerasi eucariotiche; promotori e formazione dei complessi di inizio dei geni di classe I, II e III; fattori basali della trascrizione dei geni di classe II; l'iniziatore; assemblaggio del complesso di inizio; elementi distali ed enhancers; organizzazione modulare dei fattori trascrizionali; esempi di domini di legame al DNA; regioni di dimerizzazione dei fattori trascrizionali; regioni di transattivazione; interazioni con l'apparato basale; metodologie analitiche per lo studio della trascrizione; regolazione della trascrizione; metilazione del DNA e trascrizione; modificazioni della cromatina e trascrizione Modificazioni e maturazione dei trascritti Modificazioni alle estremita': capping e poliadenilazione; lo spliceosoma; meccanismi di splicing; lo splicing autocatalitico; stabilita' e degradazione dei trascritti; interferenza a RNA; microRNA; i ribozimi; editing dei trascritti La traduzione Struttura e funzione dei tRNA; le amminoacil-tRNA sintetasi; RNA ribosomali e ribosomi; l'inizio della traduzione; cis-elements e fattori di inizio; allungamento della catena polipeptidica e fattori di allungamento; terminazione della traduzione Trasduzione del segnale Trasduzione di segnali mitogenici: recettori tirosin-chinasi; adattatori molecolari e domini di interazione proteina-proteina; la proteina G monomerica ras e la cascata delle MAPK; regolazione trascrizionale mediata da recettori tirosin-chinasi Trasduzione di segnali mediati da proteine G eterotrimeriche; attivazione di PKA; regolazione trascrizionale mediata da cAMP; CREB e l'elemento di risposta CRE Laboratorio di Biologia Molecolare Vettori e strategie di clonaggio; genoteche; sequenziamento del DNA; amplificazione del DNA; PCR quantitativa; sistemi di espressione procariotici ed eucariotici; produzione e purificazione di proteine ricombinanti; silenziamento genico; analisi di microarrays.
